✎ sante [Wiki ubuntu-fr]

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====== Médical et Santé ======

Cette page recense les logiciels autour du thème de la santé, ainsi que des logiciels médicaux, fonctionnant sous Ubuntu.

===== Logiciels pour professionnels du médical =====

==== Gestion médicale / Consultation ====

* [[:FreeMedForms]] : set d'applicatifs pour la gestion des dossiers patients, la prescription de médicaments et le calcul des interactions médicamenteuses. Logiciel libre et open source sous licence GPL.
  * [[Freehealth]] : Un fork de Freemedforms, utilisant mariadb.
  * [[:MedinTux]] : suite logicielle pour médecins (gestion de dossier médical, codification, ordonnances, certificats, etc.) Logiciel libre et open source sous licence CeCILL.
  * [[https://libreosteo.github.io/|Libreosteo]] : Logiciel libre à la destination des ostéopathes sous licence GPLv3
  *[[Soins2000]] (//via// Wine) : Infirmier, planning de soins, comptabilité ([[https://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=154217|Discussion sur le forum]]) Logiciel sous licence professionnelle privée.
  * [[https://www.ubinect.fr/|Ubinect]] : logiciel sous licence professionnelle privée de gestion d'activité pour les professions libérales de la santé (kiné, infirmier ...) : gestion de planning, télétransmission, lecture de carte vitale etc. Fonctionne jusqu'à Ubuntu 16.04. [[https://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=2025039|Problème]] avec version plus récente.
  * [[https://www.gnuhealth.org/|MyGNUHealth]] : logiciel de dossier médical personnel libre et open source.
  * [[https://www.open-emr.org/|Open-Emr]] est un dossier médical électronique et une application de gestion de cabinet médical open source.
  * [[https://hcw-at-home.com|HCW@home]] est une plateforme open source de téléconsultation permettant aux soignants d'interagir avec les patients et leurs proches par chat, audio et vidéo.
==== Système d'information hospitalier (SIH) ====

* [[:Mediboard]] : Système d'information hospitalier adapté aux établissements de santé de toute taille, du simple cabinet de praticien au centre médical multi-sites. Logiciel libre et open source sous licence GPL.
  * [[http://health.gnu.org|GNU Health]] est un progiciel libre dans le domaine de la santé dont les fonctionnalités couvrent le dossier médical personnel, le système d'information hospitalier et l'informatique médicale. Logiciel libre et open source sous licence GPL. [[https://elkafil.blogspot.fr/2017/07/installation-gnuhealth-sur-ubuntu-1604.html|Procédure d'installation pour Ubuntu]].
  * [[:Medocs]] ([[http://www.mesureware.net/Medocs.htm|Site officiel]]) : pour les besoins de services hospitaliers, mais peut aussi être utilisé dans des structures de consultation. Logiciel sous licence professionnelle privée.

====Imagerie médicale====
{{ http://ricardopereira.org/temp/foruns/invesalius.jpg?250}}
La [[wpfr>tomodensitométrie]] (TDM), dite aussi scanographie, tomographie axiale calculée par ordinateur (TACO), [[wpfr>CT-scan]] (CT = Computed Tomography), [[wpfr>CAT-scan]]  (CAT = Computer Assisted Tomography).

2 et 3 dimensions :
  * [[3D Slicer]] ([[http://www.slicer.org/|site (en)]] multi-plateforme (écrit en C++, Python, Qt), interface en anglais (BSD-style)
  * [[CTSim]] ([[http://ctsim.org/|site]])
  * [[GIMIAS]] ([[http://gimias.org/|site (en)]] Windows, Linux (écrit en C++) (BSD-style)
  * [[Ginkgo CADx]] ([[http://ginkgo-cadx.com/|site (en)]]) multi-plateforme (écrit en C++) (LGPL)
  * [[ImageJ]] ([[http://rsb.info.nih.gov/ij//|site (en)]])  multi-plateforme (écrit en Java), interface en anglais (Public Domain, BSD-2)
  * [[InVesalius]] ([[http://svn.softwarepublico.gov.br/trac/invesalius|Site officiel]]) : logiciel avancé d'imagerie médicale (tomographie, IRM…) multi-plateforme (écrit en Python) (GNU GPL2)
  * [[ITK-SNAP]] ([[https://www.itksnap.org/pmwiki/pmwiki.php|site (en)]]) multi-plateforme (écrit en C++) (GNU GPL)
  * [[Weasis]] ([[https://weasis.org/fr/|site (fr)]]) multi-plateforme (écrit en Java), multilingue.(Au 10/08/2025, le flat proposé ne reconnaît pas le lecteur de CD. Un .deb plus fonctionnel est proposé [[https://weasis.org/en/getting-started/|ici]]).

2 dimensions :
  * [[Amide]] : logiciel complet de visualisation et d'analyse d'images médicales.

Voir d'autres [[http://www.ohloh.net/tags/medical|logiciel libre sur ohlo]]

====Système de détection de maladie====

Voir également [[https://secure.wikimedia.org/wikipedia/en/wiki/Computer-aided_diagnosis|Computer-aided detection (CADe) and computer-aided diagnosis (CADx) ]].
  * L'objectif est le taux détection proche de 100%, sans faux positif, sans erreur.

* [[CADDS]] (Computer Aided Disease Detection System) ([[http://cadds.sourceforge.net/|site]]): Les Ensembles de données médicales (dans un fichier texte, avec des valeurs séparées par des espaces par exemple) peuvent être chargées dans le système. En choisissant l'un ou l'autre des deux classificateurs, le réseau de neurones ou arbre de décision ([[intelligence artificielle]], le système peut être formé et évalué.
  * [[Openbiomind]] ([[https://code.google.com/p/openbiomind/|source]]) ([[http://www.biomind.com/|site]] ) ( [[http://wiki.opencog.org/w/Neurobiological_Data_In_OpenBiomind|documentation]] ). Une boîte à outils pour l'analyse de l'expression génique, SNP et d'autres ensembles de données biologiques en utilisant des techniques d'apprentissage machine avancées. A démontré un taux de réussite proche de 100% pour l'analyse de gène et la détection de maladie.

====Dictionnaire de médicaments====

* [[:FreeDiams]] est le prescripteur de la suite FreeMedForms. Permet de gérer les prescriptions et les interactions médicamenteuses. Plusieurs bases de données libres. Logiciel libre et open source sous licence GPL.
  *[[http://www.vidal.fr/fiches-medicaments|Vidal]] (//via// Wine) : Bible pharmacologique des médecins ([[http://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=158210|Discussion sur le forum]]) Logiciel sous licence professionnelle privée.

====Médecine et Réalité augmentée=====
   * La réalité augmentée dans le cadre de la médecine, avec des appareils ( type [[telephonie|smart-phone]] ) couplés avec divers capteurs, est un [[http://technoccult.net/archives/2010/01/11/augmented-reality-medical-app/|concept]] qui se développe

====Machine médicale et Robotique====

Machine médicale et Robotique et logiciel lié.

Machine de bloc opératoire :
   * Logiciel libre : [[http://brl.ee.washington.edu/laboratory/node/26|Raven: A Surgical Robot System for Open and Minimally Invasive Surgery]]. [[http://www.kurzweilai.net/an-open-source-robo-surgeon|An open-source robo-surgeon]]
   *

Voir la page [[robotique#hopitaux|robotique]]

===== Bien-être des utilisateurs d'ordinateur (employés de bureau, etc)=====

==== Les pauses ====

* [[:Workrave]] : petit logiciel pour ne pas oublier de se détendre régulièrement, propose aussi des exercices de relaxation
  * [[:RSIbreak]] : petit logiciel pour ne pas oublier de se détendre régulièrement
  * On peut retrouver une fonction semblable dans les paramètres du clavier, onglet "Pause de saisie"

==== Mémorisation ====
  * [[gbrainy]] Mémorisation et autres exercices ( installé par défaut )
  * [[:Anki]] : logiciel de répétition espacée
  * [[:Mnemosyne]] : logiciel de répétition espacée
  * [[Organizer]] (org-mode sous Emacs)
  * [[Genius]] ([[https://sourceforge.net/projects/genius/|site]])
  * [[FriLogos]] (assistant pour la rééducation en orthophonie) ([[http://frilogos.org/|site]])

[[Carte Heuristique]]
  * [[Freeplane]] (cartes mentales)
==== Confort visuel ====

* [[F.lux]] : améliorer votre confort visuel en réglant luminosité et couleur de votre écran.
  * [[Redshift]] ([[https://launchpad.net/redshift|Site officiel]]) : améliorer votre confort visuel en réglant luminosité et couleur de votre écran. (équivalent libre de F.lux)

====Confort du clavier====

Vous pouvez changer la disposition du clavier afin de limiter les efforts de vos mains/doigts. Il faut 3 semaines / un mois pour apprendre un nouveau clavier, moins si on s'entraine. Voir la page [[clavier#changement de la configuration linguistique du clavier]] et essayer une des dispositions suivantes : **[[wpfr>Disposition_Dvorak#Dvorak-fr|Dvorak-fr]]** ou **[[wpfr>Disposition_Dvorak#B.C3.A9po|Bépo]]**.

Voir également [[reconnaissance vocale]]

====Confort de la souris====

Il existe des souris ergonomiques. ( par exemple [[http://www.evoluent.com/vm3.html|Evoluent]] )

Voir également [[headtracking]], [[eyestracking]], ...

====Autres====

Consulter le portail **[[:accessibilité]]**.

===== Bien-être / Sport =====

==== Menstruation ====

* [[:Cycle]] : calculer les jours avant les menstruations, les jours de "sécurité" le sexe, la période fertile, et les jours à ovulations, et définir la date de naissance d'un enfant, etc.
  * [[:Mencal]] : calendrier de menstruation

==== Sport ====

* [[:Pytrainer]] : gérer les logs d'activité sportives telles que la course à pied, le cyclisme, le roller etc. Communique avec votre GPS. 
  * [[:CycloGraph]] ([[http://cyclograph.sourceforge.net/|Site officiel]]) : logiciel pour cyclistes
  * [[GPSSportTrace]] : exploitation des traces GPS multisport pour ForeRunner et autre GPS sportif reconnu par Gpsbabel. Utilisable pour de nombreux sports, de la simple randonnée jusqu'au sport mécanique.
  * [[TurtleSport]] : exploite vos sessions GPS fitness de marque Garmin (Forerunner et Edge).
  * [[BBCalc]] ([[http://linux.softpedia.com/get/Science/BBCalc-23365.shtml|Site officiel]]) : calculateur pour body-building et fitness
  * [[Fitness-Sistema]] ([[http://linux.softpedia.com/get/Utilities/Fitness-Sistema-17066.shtml|Site officiel]]) : calculateur pour fitness

==== Suivi du poids ====

* [[:Pondus]] : permet de tracer une courbe sur l'évolution de son poids à travers le temps. ([[http://www.open-stream.fr/logiciel-libre/pondus-surveillez-votre-poids/|Présentation]], [[apt://pondus|Installation en 1 clic]])

===== Réduction du stress =====

==== Mise en place du télétravail ====

Le télétravail peut permettre de réduire le stress des employés. L'organisation de l'entreprise peut être totalement décentralisée, avec des outils de [[travail collaboratif]], des outils de [[visio conférence]] et [[web conférence]], et une politique zéro papier ([[ged|Gestion Électronique des Documents (GED)]]).

==== Musicothérapie ====

Utilisez votre [[lecteur audio]] préféré et écoutez une musique calme et reposante (des musiques libres sont disponibles dans [[le monde du libre#musique libre|cette sélection de sites]]).

Le logiciel [[audacity|Audacity]] est capable de générer des [[https://fr.wikipedia.org/wiki/Bruits_colores|bruits colorés]]. Dans la barre de menu, choisissez "générer", puis "bruit". Vous pourrez indiquer le temps voulu pour la durée de votre son coloré.
Ces bruits sont susceptibles d'être utilisés dans le traitement des acouphènes, endormir les bébés, détendre les animaux, etc.
Pour les utiliser aux mieux de leur capacités, veiller à choisir, au mieux, un   [[https://fr.wikipedia.org/wiki/Format_de_fichier_audio|format audio]] sans aucune compression ou une compression minime. Bien évidemment, vous n'utiliserez pas de compresseur, booster de basse ou equaliseur sur votre logiciel de lecture.

====Dépendance====
   * [[SelfControl]] ([[http://svn.jklmnop.net/projects/SelfControl.html|site]]) vous permet de définir une liste noire dans laquelle vous mettez les sites à bloquer après une VISITE, et vous définissez ensuite combien de temps vous souhaitez bloquer ces sites.

=====Interface et accessibilité=====

Une [[interface cérébrale]], ou un [[capteur de mouvement]](kinect) peut être utilisé pour la visualisation de données médicales, ou les opérations à distance par [[robotique]].

* [[Matériel libre]]
    * Open Prosthetics Project ([[http://openprosthetics.org/|site]]) des projets de prothèses libres. [[http://www.framablog.org/index.php/post/2010/11/12/prothèses-libres-pour-mieux-vivre|Article : Des prothèses libres pour mieux vivre]] (framablog)
    * Open Myoelectric Signal Processor ( [[http://openprosthetics.wikispot.org/Open_Myoelectric_Signal_Processor|site]]
    * Whirlwind Wheelchair International ( [[http://www.whirlwindwheelchair.org/|site]] ) des chaises roulantes libres ( design mis sous domaine public ).
    * Open EEG ( Électro-encéphalographie ) ( [[http://openeeg.sourceforge.net/doc/|site]] )
    * Pandemic Ventilator Project  ( [[https://panvent.blogspot.com/|site]] ) assistance respiratoire ) Interface matériel pour gérer les signaux du corps afin de diriger des prothèses.
    * EyeWriter Project ( [[http://www.refresheverything.com/eyewriter|site]] ) Permettre a des handicapés de communiquer avec les yeux.

===== Voir aussi =====

* [[http://www.osdd.net/|Opensource Drug Discovery (osdd)]] : Recherche des médicaments opensource, et en collaboration. Les Découvertes résultant de ces recherches ne seront pas brevetées, mais plutôt, elles seraient mises à la disposition de tous, dites «pharma virtuelle», comme l'[[http://www.oneworldhealth.org/|Institute for OneWorld Health]] et la [[http://www.dndi.org/|Drugs for Neglected Diseases Initiative]], ainsi le développement et la production, et (autant que possible) sera possible dans les pays touchés eux-mêmes permettant la production locale. TDI n'a pas encore finalisé les détails de son modèle de propriété intellectuelle; l'article publié répertorie certaines des [[http://medicine.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pmed.0010056|options de licence libre]].
    * [[https://fr.wikipedia.org/wiki/Plantes_utilis%C3%A9es_en_phytoth%C3%A9rapie|Liste des plantes utilisées en phytothérapie]]
  * [[http://p2pfoundation.net/Open_Source_Medicine|Medecine Open Source]] et [[http://p2pfoundation.net/Category:Health|catégorie santé]]
    * [[http://www.medpedia.com/|MedPedia]] Une plate-forme ouverte reliant des personnes et des informations pour faire avancer la médecine. ( en association avec les universités : harvard, stanford
  * [[http://silibre.free.fr/spip/rubrique.php3?id_rubrique=1|SIlibre]]: Soin et Informatique libres
  * [[http://adullact.net/softwaremap/trove_list.php?form_cat=387|Logiciels de santé sur Gforge]] (opensource)
  * [[https://www.medfloss.org/node/271|Liste de logiciels libres sur Medfloss]]
  * [[http://www.google.com/Top/World/Fran%C3%A7ais/Sant%C3%A9/M%C3%A9decine/Informatique/Logiciels/Dossier_m%C3%A9dical/|Logiciels de santé sur dmoz]]
  * [[http://silibre.free.fr/spip/rubrique.php3?id_rubrique=1|Sélection de logiciels libres pour le monde la santé (santé libre)]]
  * Discussion [[https://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=91010|"Gestion de la patientèle"]] sur le forum ubuntu-fr
  * Discussion [[https://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=360995&p=2|"télétransmission Sesam Vital des FSE avec que du Linux"]] sur le forum ubuntu-fr
  * [[https://nursingassistantguides.com/2009/50-successful-open-source-projects-that-are-changing-medicine/|50 Successful Open Source Projects That Are Changing Medicine]]
  * [[http://mastersinhealthinformatics.com/2009/25-open-source-software-projects-that-are-changing-healthcare/|25 Open Source Software Projects that Are Changing Healthcare]]
  * [[https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_open_source_healthcare_software|List of open source healthcare software]] (wikipedia en )
  * [[https://opensource.com/life/10/2/five-sites-open-source-healthcare|Five sites for open source healthcare]]
  * [[http://medecinelibre.net|Mémoire "Logiciels libres, gauche d'auteur et soins de premier recours" soutenu en 2013 à la faculté de médecine de Marseille.]]

Service en ligne :
  * [[http://bodybrowser.googlelabs.com/|Body Brower]] (google) Exploration du corps humain en 3D, le google earth du corps humain, nécessite un navigateur compatible webgl

====Information====

* [[http://singularityhub.com/category/medical/|Singularityhub avec mot clés médical]]
     * [[https://singularityhub.com/2010/07/06/10-cellphone-microscope-wins-3-awards-heading-to-africa-for-tests/|Un microscope pour téléphone portable à 10 dollar gagne 3 récompense, bientôt testé en Afrique]] ( a gagné des prix de : Bill and Melinda Gates Foundation (worth $100,000), the National Geographic Emerging Explorer award (worth $10,000), and the CAREER award from the National Science Foundation ($400,000) )
     * **[[https://singularityhub.com/2010/06/28/3-ground-breaking-miniature-biosensors-that-could-change-world-medicine/|3 biocapteurs miniatures qui vont changer la médecine mondiale]]** ( et a moindre cout )
       * Lawrence Livermore Microbial Detection Array (LLMDA) : Biocapteur capable d'identifier les microbes en 24 heures. Peut identifier actuellement 2000 virus et 900 bactérie, une version plus poussée est en développement permettant d'identifier 5700 virus, des centaines de bacteries, le fungi tout comme 75 protozoa.
       * Frederick Balagaddé's Bio-lab sur une Microchip : puce microfluidique basée sur la détection qui fonctionne non seulement pour détecter le VIH mais aussi permet de déterminer la charge virale chez les patients. Permet d'analyser 100 test de patients en 4 heures.
       * George Whitesides's Postage-Sized Laboratory : ce biocapteur peut être utilisé pour la détection de divers composés biologiques qui peuvent atteindre la santé et créer une maladie. Un exemple serait la concentration de glucose dans le sang.
   * L'importance d'une bonne checklist avant des opérations sauve des vies :
     * [[http://metamodern.com/2010/11/03/for-the-next-nobel-prize-in-medicine-i-nominate/|Une bonne checklist chirurgicale a été utilisée]] - lors d'une recherche de trois mois dans huit hôpitaux, sur plusieurs continents, et près de 4000 patients, **une nouvelle technique réduit de graves complications chirurgicales de 36% et les décès de près de 50% - en chiffres bruts**, plus de 150 cas de préjudices graves et près de 30 décès de patients ( voir [[http://www.safesurgery.org.uk/Reports/0/the_new_england_journal_of_medicine_article_2009.pdf|les résultats des chercheurs dans le pdf officiel]] ). Eric Drexler souligne les avantages décrits dans le livre : [[http://www.amazon.com/gp/product/0805091742?ie=UTF8&tag=metamodern-20&linkCode=as2&camp=1789&creative=9325&creativeASIN=0805091742|Le manifeste de la checklist]] ( propose une checklist composée de 19 points ).
   * [[https://www.tedmed.com/videos|TEDMED]] : les conférences [[http://www.ted.com/|TED]] mais pour la médecine. "Ça vaut le coup de diffuser les idées"
   * [[http://listes.medecinelibre.net/librehealthcare|LibreHealthCare]]: liste de discussion francophone sur les logiciels libres en santé. Thèmes abordés: logiciels libres et open source, standards libres, protocoles libres, matériel libre, confidentialité des données personnelles, le tout en rapport avec la santé.
===== Pages en rapport avec la santé =====

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//**Contributeurs principaux :** [[utilisateurs:psychederic|Psychederic]], [[:utilisateurs:draco31.fr]], [[:utilisateurs:arkanoid|Jérôme Pinguet]].//

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Résumé

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